Черкаський фізико-математичний ліцей розміщується у триповерховій будівлі, збудованій у 1953 році. До заснування ліцею в приміщенні ФІМЛІ розташовувались загальноосвітня школа № 13, а пізніше НВК. Сьогодні для навчання учнів і організації позакласної роботи в ліцеї створені всі умови. В навчальному закладі діють:

• 4 кабінети математики,
• 2 кабінети фізики і фізична лабораторія, обладнані для повного виконання програми поглибленого курсу фізики,
• 2 кабінети основ інформатики і обчислювальної техніки,
• 3 кабінети англійської мови,
• 2 кабінети української мови і літератури,
• кабінет історії і правознавства,
• кабінет хімії та біології,
• кабінет географії,
• для проведення уроків з фізичної культури і занять спортом є спортивний і тренажерний зали, обладнано спортмайданчик,
• для проведення свят і урочистостей у приміщенні ФІМЛІ є актова зала;
• для забезпечення учнів гарячим харчуванням в ліцеї діє шкільна їдальня.
• на кожному поверсі ліцею обладнано зручні сучасні туалети.

Кабінети математики обладнано сучасними мультимедійними засобами навчання: мультимедійними дошками, проекторами, ноутбуками для вчителів.

У 2019 році повністю переобладнано один із кабінетів інформатики: 15 учнівських комп'ютерів та робоче місце вчителя, сучасний мультимедійний проектор.